世界首个野生梨基因组图谱组装成功

  • 时间:
  • 浏览:4
  • 来源:大发5分快乐8登入网址-大发5分快乐8网站

近日,国际植物学领域权威期刊《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)在线发表世界首个野生梨高质量基因组图谱。该研究成果由中国农业科学院果树研究所研究员曹玉芬团队生和熟国科学院遗传与发育生物学研究所研究员田志喜团队等战略合作完成。

科研人员以山西杜梨为材料,结合PacBio三代测序、Bionano光学图谱、Hi-C技术,组装了高质量的杜梨参考基因组序列,是我国在梨基因组学研究领域又一重大研究进展。

论文第一作者、果树研究所董星光博士介绍,杜梨基因组组装大小为532.7Mb,contig N500为1.57Mb,共有59,55另十个 蛋白质编码基因和247.4Mb重复序列被注释,通过BUSCO对基因组删改性进行评估,删改性达到95.9%。

杜梨扩张基因在次生代谢通路中显著富集,如果进而影响杜梨较强的逆境适应性。同源基因比对分析结果显示,驯化过程中,东方梨的果实大小、糖代谢和转运,以及光合传输波特率受到正向选着。杜梨基因组中总共鉴定出57十个 NBS类型抗病基因,其中5000个是TNL型抗病基因,在已发表的蔷薇科基因组中数量最多,解释了杜梨作为野生种的强抗病性。

论文一齐通讯作者曹玉芬告诉《中国科学报》,在驯化过程中,梨属植物果实的酸涩味逐渐消失。研究发现,杜梨原花青素合成底部形态基因拷贝数显著多于白梨,影响了原花青素的积累。一齐,花青素还原酶(ANR)代谢途径是原花青素合成的唯一途径,山梨醇转运蛋白(SOT)跨膜转运如果是影响可溶性有机物质积累的主要因素。

曹玉芬说,该基因组的宣告充足了梨属植物基因组信息,一齐将为梨基因组研究、功能基因挖掘、梨属植物驯化以及野生资源利用提供重要保障。

猜你喜欢

全国各地高温天气预警,微信ETC助手足不出户35秒办理ETC

入伏以来,全国各地跳出持续高温天气,一波接一波的热浪我能 直呼“受不了”,中央气象台在7月31日6时继续发布高温黄色预警。多地最高气温达37~39℃,局部地区可达40℃以上,

2020-01-20

大雪封山33名驴友被困云南贡山 警方:无人员冻伤

新京报讯(记者李一凡实习生张慧)受云南怒江州降雨降雪天气影响,33名驴友被困贡山县孔雀山。12月21日上午,新京报记者从贡山县公安局证实,33名被困人员和11辆被困车辆,已完整

2020-01-19

余承东力挺荣耀智慧屏:首发鸿蒙OS 将带来颠覆性体验

8月10日下午,荣耀健康智慧屏在东莞正式发布。发布会上,华为消费者业务CEO余承东亲自站台,并发表演讲。余承东表示,荣耀品牌的目标是中国前二,全球前四。2019年上3天新增安卓

2020-01-19

OPPO 新机外观设计专利曝光:新型“V”字形滑出式镜头模组

8月5日消息,据外媒LetsGoDigital报道,近日,在WIPO(世界知识产权组织)的数据库中出现了一一一有一个关于OPPO手机新型滑出式镜头模组的外观设计专利。据专利页面

2020-01-19

暑期购机困难症犯了?这一千元机堪比超能旗舰

如今,这么来越多的千元机活跃在智能手机市场中,日益成为主流,而将千元机做到旗舰水准的厂商却十分罕有,通过不断创新以及产品迭代,千元机的性能以及配置随需求不断提升,这么哪些地方地

2020-01-19